 |
Ученые АлтГУ разработали инновационный способ диагностики инфекционных заболеваний
Авторитетный швейцарский научный журнал Frontiers in Immunology, освещающий вопросы иммунологии и рассказывающий о последних достижениях в этой области, опубликовал статью ученых Российско-Американского противоракового центра Алтайского государственного университета и кафедры физико-химической биологии и биотехнологии Института биологии и биотехнологии АлтГУ под руководством академика РАН Ольги Ивановны Лаврик.
Работа под названием «Доменное сканирование: Комбинаторная Серологическая диагностика инфекционных заболеваний с использованием машинного обучения» (Domain-Scan: Combinatorial Sero-Diagnosis of Infectious Diseases Using Machine Learning) посвящена совместному исследованию ученых АлтГУ с коллегами из университета Тель-Авива (Израиль) и института Макса Планка (Германии), которое позволило сформировать серодиагностический подход, основанный на использовании фаговых пептидных библиотек.
В основе подхода, получившего название «доменное сканирование» (Domain-Scan), лежит использование методов высокопроизводительного секвенирования (NGS) в сочетании с методами машинного обучения. Благодаря этому ученым удалось одновременно изучить связывание антител сывороток крови с десятками эпитопов, то есть частями макромолекул вирусов, например, таких, как ВИЧ-1 и HCV (вирусный гепатит С). Когда разработанный метод был использован для классификации неизвестных сывороток, он не только обеспечил точную классификацию, но и позволил определить профиль эпитопной специфичности.
«С университетом Тель-Авива у нас подписано соглашение о сотрудничестве. Мы уже на протяжении нескольких лет успешно сотрудничаем с лабораторией профессора Гершони, одного из крупнейших специалистов в области фагового дисплея, и планируем продолжить нашу исследовательскую работу, - отметил ведущий научный сотрудник Российско-американского противоракового центра АлтГУ, к.б.н. Дмитрий Николаевич Щербаков. – Разработанный нами подход действительно прорывной. И дело даже не в модных ныне методах машинного обучения и секвенирования нового поколения. Дело в том, что этот метод позволяет одновременно получать информацию о спектре эпитопов, с которым взаимодействуют антитела из сывороток крови больных. Этот метод очень сильно похож на чиповые методы, которые наш коллектив развивает совместно со Стефаном Джонстоном из Аризонского университета, но, на мой взгляд, он более открыт и доступен для большего числа исследователей».
Разработанный экспериментально-вычислительный подход Domain-Scan является универсальным и может быть адаптирован к другим патогенам при условии предоставления достаточных обучающих выборок.
«Разработанный нами подход «доменного сканирования» можно использовать не только для выявления инфекционных заболеваний, но и для диагностики онкозаболеваний. По профилю антител, которые находятся у человека в крови, можно с помощью «доменного сканирования» определять различные заболевания», - подытожил Д.Н. Щербаков.
Контактное лицо: Алексей Григорьевич Козерлыга
Компания: Алтайский государственный университет
Добавлен: 17:43, 12.02.2021
Количество просмотров: 229
Страна: Россия
| ХГУ подготовил для студентов дайджест новогодних каникул с пользой, Хакасский государственный университет им. Н.Ф. Катанова, 02:19, 29.12.2024, Россия243 |
| Новогодние каникулы – долгожданное время отдыха, которое студенты Хакасского госуниверситета могут провести с пользой. Пресс-служба вуза предлагает 10 альтернативных идей приятного и полезного времяпровождения. |
| ХГУ: топ-10 значимых событий уходящего года, Хакасский государственный университет им. Н.Ф. Катанова, 01:53, 29.12.2024, Россия40 |
| Новый год – традиционное время для подведения итогов. Пресс-служба Хакасского госуниверситета подготовила топ-10 событий уходящего года. |
| ХГУ одновременно с экспозицией в Риме присоединился к международной выставке, Хакасский государственный университет им. Н.Ф. Катанова, 23:43, 27.12.2024, Россия151 |
| Выставка комиксов-плакатов познакомит с жизнью, творчеством и произведениями писателя. Международная выставка приурочена к 100-летию со дня смерти Франца Кафки и создана при участии Гёте-Института и Литературного дома Штутгарта. Она проходит по всей Европе и России – от Москвы до Владивостока. Выставка в ХГУ открылась одновременно с экспозицией в Риме. |
| В Тюмени прошла VI Научная конференция «Университетская клиника», РНИМУ им. Н.И. Пирогова МЗ РФ, 04:02, 27.12.2024, Россия176 |  |
| Мероприятие объединило на одной площадке академиков, профессоров, ученых и ведущих специалистов различных областей.
Главная особенность конференции — ее многопрофильность. Участники обсудили не только вопросы здравоохранения, но и связь общеобразовательных аспектов с медициной. |
| Состоялась VIII Всероссийская олимпиада по ЭКГ имени Виктора Алексеевича Люсова «Золотой стетоскоп», РНИМУ им. Н.И. Пирогова МЗ РФ, 04:00, 27.12.2024, Россия173 |  |
| 11 декабря на базе Городской клинической больницы № 15 имени О.М. Филатова прошли испытания по электрокардиографии с международным участием. Мероприятие организовано кафедрой госпитальной терапии имени академика П.Е. Лукомского Института клинической медицины, кафедрой скорой и неотложной медицинской помощи факультета дополнительного профессионального образования Пироговского Университета и Медицинским институтом РУДН имени Патриса Лумумбы. |
|
|
